A salinidade mede a quantidade de sais dissolvidos nas águas, formado pelos bicarbonatos, cloretos, sulfatos e, em menor quantidade, pelos demais sais, pode ser medida em "partes por milhão" (ppm) em águas salobras ou "partes por bilhão"(ppb) e "partes por trilhão" (ppt) em água doce. A salinidade tende a ser maior no verão que no inverno, por motivo da evaporação de uma maior quantidade de água no período mais quente. A alta salinidade em um corpo d'água pode resultar em obstáculo à sobrevivência de determinadas espécies menos tolerantes a este fator, assim como conferi à água características incrustantes.